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You are here: FRIAS Fellows Fellows 2016/17 Prof. Dr. Jörn Dengjel

Prof. Dr. Jörn Dengjel

Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Biochemistry, Dermatology, Proteomics
Internal Senior Fellow
October 2015 - July 2016

Phone +49 (0)761-203 97208

CV

Jörn Dengjel studierte Biochemie in Potsdam und Tübingen, wo er auch seine Dissertation anfertigte. In den Arbeitsgruppen von Hans-Georg Rammensee und Stefan Stevanovic am Institut für Zellbiologie, Abteilung Immunologie, erforschte er wie T-Zellen dazu gebracht werden können, körpereigene Tumorzellen zu erkennen und diese abzutöten. Seine Arbeiten führten zu mehreren Patenten. 2005 wechselte er zur Start-Up Firma Immatics Biotechnologies, einer Ausgründung der Abteilung Immunologie, und setzte dort seine Arbeiten an Peptid-basierten Anti-Tumorimpfstoffen fort. 2006 wechselte er als Postdoc an das Center for Experimental Bioinformatics der University of Southern Denmark, Odense. Dort studierte er in den Arbeitsgruppen von Matthias Mann und Jens Andersen Signalprozesse in Krebszellen und wie Zellen die Stabilität von Proteinen regulieren. Mit dem Erhalt eines Junior Fellowships des Freiburg Institute for Advanced Studies (FRIAS) 2008 etablierte er seine eigene Arbeitsgruppe in Freiburg am Zentrum für Biosystem Analyse (ZBSA). Seit Dezember 2013 ist Jörn Dengjel nun Professor für Medizinische Proteomforschung an der Klinik für Dermatologie und Venerologie des Universitätsklinikums Freiburg. Er erforscht die Deregulierung der extrazellulären Matrix in genetischen Hauterkrankungen und deren zellulären Einfluss. Außerdem interessiert in die Qualitätskontrolle von Proteinen und ihr intrazellulärer Umsatz.


Selected Publications

  • Dumit VI, Küttner V, Käppler J, Piera-Velazquez S, Jimenez SA, Bruckner-Tuderman L, Uitto J, Dengjel J. (2014). Altered MCM Protein Levels and Autophagic Flux in Aged and Systemic Sclerosis Dermal Fibroblasts. J Invest Dermatol. 134:2321-30.
  • Rigbolt KTG, Zarei M, Sprenger A, Becker AC, Diedrich B, Huang X, Eiselein S, Kristensen AR, Gretzmeier C, Andersen JS, Zi Z, Dengjel J. (2014). Characterization of early autophagy signaling by quantitative phosphoproteomics. Autophagy 10:356-71.
  • Abeliovich H, Zarei M, Rigbolt KTG, Youle RJ, Dengjel J. (2013).Involvement of mitochondrial dynamics in the segregation of mitochondrial matrix proteins during stationary phase mitophagy. Nat Commun. 4:2789
  • Küttner V, Mack C, Rigbolt KTG, Kern JS, Schilling O, Busch H, Bruckner-Tuderman L, Dengjel J. (2013). Global remodeling of cellular microenvironment due to loss of collagen VII. Mol Sys Biol. 9:657.
  • Nazio F, Strappazzon F, Antonioli M, Bielli P, Cianfanelli V, Bordi M, Gretzmeier C, Dengjel J, Piacentini M, Fimia GM, Cecconi F. (2013). mTOR inhibits autophagy by controlling ULK1 ubiquitination, self-association and function via AMBRA1 and TRAF6. Nat Cell Biol 15:406-16

 

FRIAS Research Project

Analysis of autophagosome Golgi/ER crosstalk

Autophagosomes are constitutively formed de novo in cells and induced under stress conditions and shuttle cytoplasm to lysosomes for degradation. In recent years it has been emerging that membranes from diverse sources are recruited to the nascent autophagosome to form a double membrane pre-autophagosomal structure (PAS). The function of proteins involved in COPI-mediated retrograde Golgi-ER transport will be studied in primary human cells from donors of different ages. Constitutive and autophagy-dependent protein-protein interactions will be analyzed by affinity purification mass spectrometry (AP-MS).