Prof. Dr. Oliver Schilling

CV

Oliver Schilling studied Biology and Biochemistry in Germany and France. He pursued his PhD studies at the European Molecular Biology Laboratory; employing X-ray absorption spectroscopy to characterize zinc-binding proteins. Subsequently, he joint the laboratory of Prof Dr Christopher M Overall (University of British Columbia, Vancouver, Canada) as a post-doctoral fellow in order to use mass spectrometry based proteomics to better understand the substrates and specificities of proteolytic enzymes. In 2008, Oliver Schilling joint the University of Freiburg (Institute of Molecular Medicine and Cell Research) to start his own laboratory. From 2009 – 2014 he has been an Emmy-Noether fellow of the Deutsche Forschungsgemeinschaft and from 2012 – 2017, he has been recipient of a Starting Grant of the European Research Council. Since 2018 he is a Heisenberg Professor for Translational Proteome Research at the Institute of Surgical Pathology, University of Freiburg. Research in the Schilling laboratory focuses on translational proteomics, mass spectrometry imaging, and proteolytic signaling.

Publiktionen (Auswahl)

• Föll MC, Moritz L, Wollmann T, Stillger MN, Vockert N, Werner M, Bronsert P, Rohr K, Grüning BA, Schilling O. Accessible and reproducible mass spectrometry imaging data analysis in Galaxy. Gigascience 8: 1-12, 2019

• Oria VO, Lopatta P, Schmitz T, Preca BT, Nyström A, Conrad C, Bartsch JW, Kulemann B,
  Hoeppner J, Maurer J, Bronsert P, Schilling O. ADAM9 contributes to vascular invasion in pancreatic ductal adenocarcinoma. Mol Oncol 13: 456-479, 2019

• Oria VO, Bronsert P, Thomsen AR, Föll MC, Zamboglou C, Hannibal L, Behringer S, Biniossek ML, Schreiber C, Grosu AL, Bolm L, Rades D, Keck T, Werner M, Wellner UF, Schilling O. Proteome Profiling of Primary Pancreatic Ductal Adenocarcinomas Undergoing Additive Chemoradiation Link ALDH1A1 to Early Local Recurrence and Chemoradiation Resistance.
  Transl Oncol 11: 1307-1322, 2018

• Föll MC, Fahrner M, Gretzmeier C, Thoma K, Biniossek ML, Kiritsi D, Meiss F, Schilling O^§, Nyström A^§, and Kern JS. Identification of tissue damage, extracellular matrix remodeling and bacterial challenge as common mechanisms associated with high-risk cutaneous squamous cell carcinomas. Matrix Biol 66: 1-21, 2018  ^§Shared corresponding author

• Lai ZW, Weisser J, Nilse L, Costa F, Keller E, Tholen M, Kizhakkedathu JN, Biniossek M,
  Bronsert P, and Schilling O. Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Tissues (FFPE) as a Robust Source for the Profiling of Native and Protease-Generated Protein Amino Termini.
  Mol Cell Proteomics 15: 2203-2213, 2016

FRIAS Projekt

MatrixCode: matrisome pathology

Die "extrazelluläre Matrix" (ECM) umfasst alle ausgeschiedenen, abgelagerten und löslichen Proteine im interstitiellen Milieu. Wir verstehen die ECM zusehends weniger als passives, strukturelles Gerüst, sondern als integralen Bestandteil der vielfältigen und dynamischen Signalumgebung des Gewebes. Durch ein besseres Verständnis des sogenannten "Matrisoms" verbessern wir unsere Möglichkeiten, gezielte Therapien zu entwickeln, für diese Prozesse bei Krankheit, Narbenbildung und Regeneration. Das MatrixCode-Projekt entschlüsselt, wie pathophysiologische Signalgebung von biochemischen und biophysikalischen Modifikationen der extrazellulären Matrix abhängt. MatrixCode ist aus vier Teilprojekten zusammengestellt, die sich auf verschiedene Aspekte der ECM-Signalgebung in der Wundheilung und Tumorbiologie konzentrieren. MatrixCode wird die ECM-Forschung in Freiburg stärken, indem eine kritische Masse von Wissenschaftlern geschaffen und die Bindung zu Kooperationspartnern in Straßburg und weltweit verstärkt wird. MatrixCode wird die Grundlage für nachfolgende Initiativen zur kollaborativen Finanzierung schaffen.